Au niveau central, à Paris, un Conseil Central, composé d’un conseiller ecclésiastique national désigné par la CEF et de 15 membres bénévoles, oriente et anime la vie de l’Œuvre.
De ce Conseil dépendent des comités diocésains :
un par diocèse composé d’un délégué désigné par le Conseil Central et d’un conseiller ecclésiastique nommé par l’évêque du lieu.
Le délégué diocésain reçoit les demandes de soutien des prêtres, les valide
en liaison avec le conseiller ecclésiastique et les transmet au bureau de Paris.
L’Œuvre agit ainsi en collaboration avec les évêques « sans l’approbation et la bénédiction desquels on ne veut, on ne doit, on ne peut rien faire », ce qui n’exclut pas une grande liberté d’action.